濮阳医学高等专科学校前身是始建于1951年的安阳地区卫生学校。安阳地区撤销成立濮阳市后，1988年3月筹建成立濮阳市卫生学校。1988年6月在濮阳县委党校租借校舍开始办学。1988年12月迁至中原油田高中租借校舍办学。1992年8月搬迁至濮阳市开州路办公。1995年5月省教委批准建立“濮阳市卫生成人中等专业学校”，濮阳市编办批准为副处级单位。1999年2月省教委批准成立“濮阳市卫生职业中等专业学校”。2000年被省教委认定为省级重点中等职业学校。2002年被省教育厅批准为普通中等专业学校，更名为“濮阳市卫生学校”。2005年被认定为国家级重点中等职业学校。2005年被教育部等七部门授予全国职业教育先进单位称号。

  2011年12月7日，市政府研究同意在濮阳市卫校基础上申报濮阳医学高等专科学校。2012年7月19日，濮阳医学高等专科学校筹设工作以全省第一名的优异成绩通过河南省高校设置评审委员会专家组筹设评审。2012年9月，省政府出台《关于印发河南省高等学校设置“十二五”规划》的通知》(豫政〔2012〕85号），明确提出：“濮阳市政府以濮阳市卫生学校为基础，组建濮阳医学高等专科学校”。2012年9月28日，濮阳医专（筹）校区项目建设在濮阳新区教育园区奠基。2012年9月，学校升格为正处级单位。2013年9月，濮阳医学高等专科学校建设入选濮阳建市30周年50件大事。2013年11月，省高校设置评议委员会专家组进行实地考察评审，给予了“高度满意、完全达标”的高度评价。2013年12月，省高校设置评议委员会高票通过濮阳医专的设置。2017年3月，河南省政府印发《关于建立河南轻工职业学院等5所高校的通知》，同意建立濮阳医学高等专科学校。2017年5月，获得教育部备案。2017年9月20日，濮阳医学高等专科学校举行揭牌仪式，从此进入新的发展历程。